Stéphane Minvielle est co-responsable du programme 2 « oncologie cellulaire », aux côtés de Catherine Pellat-Deceunynck et Philippe Juin.
Depuis janvier 2022, Stéphane Minvielle est co-responsable de l’équipe 8 « Integrative Cancer Genomics » du CRCI²NA. Il est impliqué dans l’analyse du profil génomique des cellules du myélome multiple et a notamment démontré l’évolution complexe des sous-populations de cellules du myélome sous la pression des traitements. Il a également créé l’Unité Mixte de Génomique du Cancer, un laboratoire hospitalier de recherche translationnelle, cogéré par le CHU de Nantes et l’ICO.